击败肉山后世界会永久性地转变为困难模式，腐化之地和神圣之地开始以稳定的节奏蔓延，如果处理不当，它们最终会占领整个世界，因此加强基地防御是玩家必须面对的首要任务。肉山后怪物的强度大幅提升，地表和地下的敌人都变得更加危险，基地原有的防御措施可能不足以应对新的威胁，玩家需要尽快升级防护手段来保护关键区域免受侵蚀和入侵。
腐化与神圣的快速扩张会直接影响玩家的基地和周边环境，破坏资源点和建筑结构，导致生存难度增加，因此及时建立隔离带是防御的核心步骤。这些蔓延不仅会改变地形，还可能生成更强悍的敌人，威胁到NPC的居所和玩家的安全空间，如果不加以控制，整个世界的生态平衡将被打破，基地的稳定性会逐渐丧失。
玩家可以使用人工方块如玻璃或石砖在基地周围建立厚达三层的隔离墙，这些材料能够抵抗腐化或神圣的转化，有效阻止蔓延的扩散。利用雷管等工具炸掉腐化区域形成隔离带也是一种实用方法，它可以切断蔓延路径，同时修建防御工事如陷阱和墙体，能显著减少怪物入侵的风险。
升级装备和利用新解锁的资源也是强化基地防御的一部分，例如通过收集新矿石制作更强的工具和武器，来应对突发威胁。NPC如机械师提供的电路道具可以用于构建自动化陷阱，进一步提升基地的主动防御能力，确保玩家在困难模式下能专注于更高级的挑战。
